Η σεζόν 2003-04 είναι για τον Πανηλειακό σημειολογική, καθώς αποτέλεσε το κύκνειο άσμα του στην Α΄ Εθνική. Είναι η σεζόν στην οποία αγωνίστηκε για τελευταία φορά στη μεγάλη επαγγελματική κατηγορία της χώρας. Υποβιβάστηκε και έκτοτε δεν επέστρεψε ποτέ ξανά. Είναι επί της ουσίας η σεζόν στην οποία ο Σάκης Σταυρόπουλος αποχώρησε από την ομάδα. Μια σεζόν γεμάτη γεγονότα, η οποία κορυφώθηκε και με μια σειρά από ατυχή αποτελέσματα. Η ομάδα που ξεκίνησε με εντυπωσιακό τρόπο και έδειχνε ότι δεν θα συναντήσει προβλήματα, κατρακύλησε στον δεύτερο γύρο και βρέθηκε κάτω από τη ζώνη του υποβιβασμού.

Ο Σάκης Σταυρόπουλος, αποχώρησε από τον προεδρικό θώκο, με τον Παναγιώτη Πλατανιά, να τον αντικαθιστά, σε μια προσπάθεια να σωθεί η ομάδα και να μεταπειστεί ο Σταυρόπουλος και να επιστρέψει.

Όλοι θα έχουν να θυμούνται από εκείνη τη σεζόν, το τελευταίο ματς στον Πύργο, στο οποίο στέφθηκε ο Παναθηναϊκός Πρωταθλητής, με γκολ του Εμάνουελ Ολισαντέμπε. Ωστόσο, για να φτάσουμε σε εκείνη την ήττα και τον υποβιβασμό, είχαν προηγηθεί και άλλα ματς, στα οποία ο Πανηλειακός έτυχε εχθρικής αντιμετώπισης από τη διαιτησία, με αποκορύφωμα ένα παιχνίδι στις αρχές του δευτέρου γύρου στην Καλαμαριά, απέναντι στον Άρη. Εκεί, ακυρώθηκε ένα πεντακάθαρο γκολ του Πανηλειακού, γκολ το οποίο είχε σημειώσει ο Ντίνος Σπυρόπουλος, προπονητής πρόσφατα και του ΠΑΟ Βάρδας, παίκτης τότε του Πανηλειακού.

Στα παρακάτω βίντεο, θα δούμε μεταξύ άλλων και το ισόπαλο 0-0 του Πύργου, ανάμεσα στον Πανηλειακό και τον Άρη, όπου ο Κάρλος Μαρκορά αστοχεί σε πέναλτι, ένα πέναλτι όμως στο οποίο ο τερματοφύλακας του Άρη, έχει βγει τουλάχιστον ένα μέτρο εκτός εστίας πριν η μπάλα φύγει από τα πόδια του Ουρουγουανού άσου του Πανηλειακού.

Εκείνη τη σεζόν, είχαμε και δυο παιχνίδια σημειιολογικά. Πρώτα την εντός έδρας ήττα από την Καλλιθέα με 5-0, ματς το οποίο σημαδεύτηκε από επίθεση σε βάρος του Αντιπροέδρου της ΠΑΕ Πανηλειακού Γιώργου Σταυρόπουλου. Και επίσης, θα δούμε και την εντός έδρας ήττα του Πανηλειακού από τον Ακράτητο με 3-0, παιχνίδι το οποίο σημαδεύτηκε από επεισόδια σε βάρος του ιδιοκτήτη της ΠΑΕ Σάκη Σταυρόπουλου. Τα δυο αυτά παιχνίδια, αλλά και τα γεγονότα που ακολούθησαν, αποτέλεσαν τη σηματοδότηση της σταδιακής αποχώρησης της οικογένειας Σταυρόπουλου από τον Πανηλειακό,

Η τελική βαθμολογία του Πρωταθλήματος 2003-04

• Παναθηναϊκός 77
• Ολυμπιακός 75
• ΠΑΟΚ 60
• ΑΕΚ 55
• Αιγάλεω 52
• Πανιώνιος 47
• Χαλκηδόνα 45
• Ηρακλής 42
• Ιωνικός 33
• Ξάνθη 30
• ΟΦΗ 29
• Καλλιθέα 27
• Άρης 27
• Ακράτητος 23
• Πανηλειακός 21
• Προοδευτική 20